东台市中医院是一所以中医为特色、中西医结合、盐城市县级医院中首家国家三级乙等中医医院。眼科为全国农村医疗机构中医特色专科专病建设项目、“十二五”江苏省中医重点专科建设项目、盐城市中医重点专科;针灸科为全国农村医疗机构针灸理疗康复特色专科建设项目单位;耳鼻咽喉科、妇科、肛肠科、内分泌病科、肿瘤科为盐城市中医重点专科;治未病科、脾胃病科为盐城市中医重点专科培育项目单位。