鄂尔多斯市蒙医医院(蒙医研究所)成立于1979年。它的建立结束了伊盟蒙医药事业的马背生涯。建所至今,经过30年的不懈努力和艰苦探索,走出了一条从无到有、从小到大、由弱到强、不断发展的路子。特别是近年来作为一所民族科研医疗机构,在党的一系列卫生方针和民族医药政策的指引下,在党和政府的大力扶持和关怀下,通过几代蒙医人的不懈努力和坚苦探索,面对现代医学技术的新形式,通过进一步深化改革,开拓创新,大力推进民族医药学的继承和发展,充分发挥民族医药特色和优势,从而促进了蒙医药事业的发展。目前,蒙医医院已发展成为我市规模最大,设备较全,人才齐备,特色浓郁,功能齐全的一所民族科研医疗机构(事业单位),是我市的蒙医医疗、科研、教学、制剂为一体的研究发展中心。

蒙医医院现有职工 275人,院领导5人;专业技术人员217人;离退休人员53名。全院正高级职称19人,副高级职称37人,硕士生导师5人,硕士学位10人,博士学位2人,蒙医药专业技术人才梯队建设初现成效,除医疗工作之外,还承担着全市蒙医教学、科研及蒙医执业医师实践技能考试、职称评定等任务。