常熟市中医院始建于1958年, 2003年底,与同样始建于1958年的常熟市二级甲等妇幼保健院合并重组,并于2004年9月整体迁入新址。在市委、市政府和社会各界的关心支持下,经过全院干部职工的共同努力,医院规模与社会声誉日益扩大,现已成为卫生部国际救援中心认定的“国际紧急救援中心网络医院”、联合国儿童基金会和世界卫生组织命名的“爱婴医院”。南京中医药大学附属医院,以及集医疗、预防保健、教学和科研于一体的二级甲等中医院。2006年组建医疗服务集团,其中海虞卫生院、福山卫生院、周行卫生院、浒浦卫生院、碧溪卫生院、吴市卫生院、董浜卫生院、王庄医院等为集团成员单位。2012年9月接受国家中医药管理局等级中医医院评审复审,被正式认定为“三级乙等”中医医院。

院坚持科教兴院、人才强院战略,大力提高科研教学水平。近三年来,共获得常熟市级科技进步奖4项,苏州市科技进步奖1项。常熟市新技术引进奖11项,苏州市新技术引进奖2项。科研立项55项,其中苏州市级以上27项。发表论文224篇,其中核心期刊38篇。