滨州市中心医院始建于1948年,前身是山东省惠民专区和平医院,历经惠民地区第二人民医院,惠民地区中心医院,2000年更名为滨州市中心医院。2007年与原滨州市结核病防治院合署。原滨州市结核病防治院是由1902年开建的英国教会医院发展而来,最初命名为如己医院,历经武定道立医院、山东省第八康复医院等,1958年建立结防所,1984年改为结防院,1998年成立肿瘤医院,2000年合称为滨州市结核肿瘤医院,2003年扩建滨州市传染病医院。2014年6月18日,滨州市中心医院正式通过省卫生厅三级甲等医院现场评审,达到三级甲等医院标准。

医院设有45个临床医技科室,9个临床教研室。骨外科、神经内科、泌尿外科、结核科、普外科、神经外科和影像中心被评为滨州市“名科”。普外科被评为山东省优质医疗服务示范科室,骨外科被山东省医院协会评为地市级中心医院临床重点专科,也是滨州市医学重点学科。滨州市麻醉质量控制中心、急诊急救质量控制中心挂靠医院。产科、重症医学科被评为山东省首批护士岗位培训临床教学基地。